MDFIC

MDFIC
Identifikatori
Aliasi	MDFIC
Vanjski ID-jevi	OMIM: 614511 MGI: 104611 HomoloGene: 18404 GeneCards: MDFIC
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 7 (čovjek)
Kraj	115,019,917 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 6 (miš)
Kraj	15,802,168 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• transcription factor binding; • Tat protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • cyclin binding;
Ćelijska komponenta	• Jedarce; • jedro; • citoplazma; • Golđijev aparat; • nukleoplazma;
Biološki proces	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of viral transcription; • regulation of Wnt signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of protein import into nucleus; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	29969
	16543
	ENSG00000135272
	ENSMUSG00000041390
	Q9P1T7
	Q8BX65
	NM_199072; NM_001166345; NM_001166346
	NM_175088
	NP_001159817; NP_001159818; NP_951038
	NP_780297
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Protein porodice inhibitora MyoD sa domenom je protein koji je kod ljudi kodiran genom MDFIC.^[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je aminokiselina, а molekulska težina 25.788 Da.^[6]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MSGAGEALAP	GPVGPQRVAE	AGGGQLGSTA	QGKCDKDNTE	KDITQATNSH
FTHGEMQDQS	IWGNPSDGEL	IRTQPQRLPQ	LQTSAQVPSG	EEIGKIKNGH
TGLSNGNGIH	HGAKHGSADN	RKLSAPVSQK	MHRKIQSSLS	VNSDISKKSK
VNAVFSQKTG	SSPEDCCVHC	ILACLFCEFL	TLCNIVLGQA	SCGICTSEAC
CCCCGDEMGD	DCNCPCDMDC	GIMDACCESS	DCLEICMECC	GICFPS

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj genski proizvod je član porodice proteina koje karakterizira specifična cistein-bogati C-terminalni domen, koji je uključen u regulaciju transkripcije u ekspresiji virusniog genom. Alternativno započinjanje prevođenja iz uzvodnog ne-AUG (GUG), i unutar okvira, nizvodnog AUG kodona, rezultira proizvodnjom dvije izoforme, p40 i p32, koje imaju različitu subćelijsku lokalizaciju; p32 se uglavnom nalazi u citoplazmi, dok je p40 usmjeren na jedarce. Obje izoforme imaju transkripcijsku regulatornu aktivnost koja se može pripisati C-terminalnom domenu bogatom cisteinom. Alternativne prerada rezultira u više varijanti transkripta.

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135272 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041390 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: MyoD family inhibitor domain containing". Pristupljeno 9. 2. 2016.
^ "UniProt, Q9P1T7". Pristupljeno 26. 9. 2021.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135272 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041390 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: MyoD family inhibitor domain containing". Pristupljeno 9. 2. 2016.

[UniProt-6] "UniProt, Q9P1T7". Pristupljeno 26. 9. 2021.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]