NOB1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NOB1
Identifikatori
AliasiNOB1
Vanjski ID-jeviOMIM: 613586 MGI: 1914869 HomoloGene: 31924 GeneCards: NOB1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za NOB1
Genomska lokacija za NOB1
Bend16q22.1Početak69,741,871 bp[1]
Kraj69,754,926 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za NOB1
Genomska lokacija za NOB1
Bend8|8 D3Početak108,139,118 bp[2]
Kraj108,151,683 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona metala
endoribonuclease activity
Ćelijska komponenta preribosome, small subunit precursor
jedro
citosol
nukleoplazma
Biološki proces maturation of SSU-rRNA
Vid
RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
rRNA processing
cleavage involved in rRNA processing
ribosomal small subunit biogenesis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014062

NM_026277

RefSeq (bjelančevina)

NP_054781

NP_080553

Lokacija (UCSC)Chr 16: 69.74 – 69.75 MbChr 8: 108.14 – 108.15 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

RNK-vezujući protein NOB1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NOB1.[5][6]

Hartz (2010) je mapirala gen NOB1 u hromosomu, regija 16q22.1, na osnovu poravnanja sekvence NOB1 (GenBank AB026125) sa genomskom sekvencom (GRCh37).

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 412 aminokiselina, a molekulska težina 46.675 Da[7].

Simboli
1020304050
MAPVEHVVADAGAFLRHAALQDIGKNIYTIREVVTEIRDKATRRRLAVLP
YELRFKEPLPEYVRLVTEFSKKTGDYPSLSATDIQVLALTYQLEAEFVGV
SHLKQEPQKVKVSSSIQHPETPLHISGFHLPYKPKPPQETEKGHSACEPE
NLEFSSFMFWRNPLPNIDHELQELLIDRGEDVPSEEEEEEENGFEDRKDD
SDDDGGGWITPSNIKQIQQELEQCDVPEDVRVGCLTTDFAMQNVLLQMGL
HVLAVNGMLIREARSYILRCHGCFKTTSDMSRVFCSHCGNKTLKKVSVTV
SDDGTLHMHFSRNPKVLNPRGLRYSLPTPKGGKYAINPHLTEDQRFPQLR
LSQKARQKTNVFAPDYIAGVSPFVENDISSRSATLQVRDSTLGAGRRRLN
PNASRKKFVKKR

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141101 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003848 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Zhang Y, Ni J, Zhou G, Yuan J, Ren W, Shan Y, Tang W, Yu L, Zhao S (Sep 2005). "Cloning, expression and characterization of the human NOB1 gene". Mol Biol Rep. 32 (3): 185–9. doi:10.1007/s11033-005-3141-7. PMID 16172919. S2CID 12892523.
  6. ^ "Entrez Gene: NOB1 NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae)".
  7. ^ "UniProt, Q9ULX3". Pristupljeno 8. 7. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]