Idi na sadržaj

FBXL2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
FBXL2
Identifikatori
AliasiFBXL2
Vanjski ID-jeviOMIM: 605652 MGI: 1919429 HomoloGene: 135814 GeneCards: FBXL2
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[1]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za FBXL2
Genomska lokacija za FBXL2
Bend9|9 F3Početak113,792,705 bp[1]
Kraj113,875,259 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit binding
protein phosphatase binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
calmodulin binding
GO:0050372 aktivnost sa transferazom ubikvitina
Ćelijska komponenta citoplazma
SCF ubiquitin ligase complex
membrana
Biološki proces SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
regulation of autophagy
GO:0022415 viral process
protein monoubiquitination
protein ubiquitination
ubiquitin-dependent protein catabolic process
Proteoliza
regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001171713
NM_012157

NM_178624

RefSeq (bjelančevina)
NP_036289
NP_001336245
NP_001336248
NP_001336249
NP_001336250

NP_001336251
NP_001336252
NP_001336253
NP_001336254
NP_001336255

NP_848739

Lokacija (UCSC)n/aChr 9: 113.79 – 113.88 Mb
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein 2 sa F-kutijskim/LRR-ponavljanjem jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FBXL2 sa hromosoma 3.[4][5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 423 aminokiseline, а molekulska težina 47.062 Da.[7]

1020304050
MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGS
NWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFA
QNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKG
ISEGCRNLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEAL
KHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDA
SLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILIT
DSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDN
CLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYF
APVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira člana porodice proteina F-kutije koju karakteriše motiv od približno 40 F-kutijskih aminokiselina,. Proteini F-kutije čine jednu od četiri podjedinice kompleksa ubikvitin-proteinskih ligaza zvanih SCF (SKP1-kulin-F-kutija), koje funkcioniraju u ubikvitinaciji ovisnoj o fosforilacijama. F-kutijski proteini su podijeljeni u tri klase: Fbws koji sadrže WD-40 domene, Fbls koji sadrže ponavljanja bogata leucinom i Fbxs koji sadrže ili različite module interakcija protein-protein ili nemaju prepoznatljive motive. Protein kodiran ovim genom pripada klasi Fbls i, pored F-kutije, sadrži 12 tandemskih ponavljanja bogatih leucinom.[6]

FBXL2 je visoko konzervirani protein F-kutije koji direktno veže supstrate i na taj način određuje specifičnost kompleksa SCF ubikvitin-ligaza. FBXL2 sadrži tipski CaaX motiv koji je posttranslacijsko modificiran geranil-geranilacijom za ciljanje na ćelijske membrane.[8][9][10] Važnost aktivnosti ubikvitin-ligaze FBXL2 prvobitno je prikazana u nepristrasnom pregledu za ćelijske faktore domaćina neophodne za replikaciju virusa hepatitisa C.[8] Geranil-geranilacija FBXL2 je također neophodna za njegovu funkciju za preživljavanje u posredovanju poli-ubikvitilacije i proteasomske degradacije IP3R3 (kalcijev kanal na endoplazmatskom retikulumu)[10] i p85β (regulatorna podjedinica PI3-kinaze).[9]

PI3K su heterodimerne lipidne kinaze sastavljene od p110 katalitske i p85 regulatorne podjedinice. FBXL2 stupa u interakciju sa skupom p85β koji nema p110 podjedinica kako bi promovirao degradaciju p85β, ali ne i p85α.[9] Degradacija p85β preko FBXL2 održava ravnotežu između p85β0 monomera i p11–p85 heterodimera za efikasnu aktivaciju PI3K kao odgovor na mitogene.

Kao odgovor na proizvodnju IP3 (inozitol 1,4,5-trisfosfata), fluks kalcija (Ca2+) između endoplazmatskog retikuluma i mitohondrija obavljaju IP3 receptori (IP3Rs). Ovaj događaj je kritičan za ćelijsku bioenergetiku. Trajanje i obim oslobađanja Ca2+ iz IP3R određuju da li će ćelija preživjeti ili uginuti: bazni nivoi oslobađanja i unosa Ca2+ u mitohondrije neophodni su za oksidativnu fosforilaciju i proizvodnju ATP-a. Međutim, prekomjeran i/ili uporan protok Ca2+ dovodi do preopterećenja mitohondrija Ca2+-om i apoptoza. FBXL2 cilja IP3R3 radi razgradnje kako bi se izbjegao prekomjeran i produžen protok Ca2+ i da bi se ublažila apoptoza, kao odgovor na stres.[10] Ovaj proces zahtijeva prisustvo FBXL2 na membranama, putem geranilgeranilacije i osjetljiv je na GGTi-2418 (CaaX peptidomimetiski inhibitor geranilgeranilacije koji je dosegao klinička ispitivanja). Razgradnju IP3R3 antagonizira tumor-supresor PTEN, koji se takmiči sa FBXL2 za vezivanje za IP3R3, čime se sprječava degradacija IP3R3 i promovira ćelijska smrt. FBXL2 je geranilgeraniliran pomoću GGTase3, četvrtog i novog člana ljudske porodice preniltransferaze, koji je identificiran u laboratoriji Michelea Paganoa.[11]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032507 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ Ilyin GP, Rialland M, Glaise D, Guguen-Guillouzo C (oktobar 1999). "Identification of a novel Skp2-like mammalian protein containing F-box and leucine-rich repeats". FEBS Letters. 459 (1): 75–9. doi:10.1016/S0014-5793(99)01211-9. PMID 10508920. S2CID 22945082.
  5. ^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (oktobar 1999). "Identification of a family of human F-box proteins". Current Biology. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016/S0960-9822(00)80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.
  6. ^ a b "Entrez Gene: FBXL2 F-box and leucine-rich repeat protein 2".
  7. ^ "UniProt, Q9UKC9" (jezik: engleski). Pristupljeno 3. 11. 2021.
  8. ^ a b Wang C, Gale M, Keller BC, Huang H, Brown MS, Goldstein JL, Ye J (maj 2005). "Identification of FBL2 as a geranylgeranylated cellular protein required for hepatitis C virus RNA replication". Molecular Cell. 18 (4): 425–34. doi:10.1016/j.molcel.2005.04.004. PMID 15893726.
  9. ^ a b c Kuchay S, Duan S, Schenkein E, Peschiaroli A, Saraf A, Florens L, et al. (maj 2013). "FBXL2- and PTPL1-mediated degradation of p110-free p85β regulatory subunit controls the PI(3)K signalling cascade". Nature Cell Biology. 15 (5): 472–80. doi:10.1038/ncb2731. PMC 3865866. PMID 23604317.
  10. ^ a b c Kuchay S, Giorgi C, Simoneschi D, Pagan J, Missiroli S, Saraf A, et al. (juni 2017). "2+-mediated apoptosis limiting tumour growth". Nature. 546 (7659): 554–558. doi:10.1038/nature22965. PMC 5627969. PMID 28614300.
  11. ^ Kuchay et al. GGTase3 is a Newly Identified Geranylgeranyltransferase Targeting a Ubiquitin Ligase. Nature Str & Mol Biol 26:628-636, 2019.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]