MRPL13

MRPL13
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	3J7Y, 3J9M
Identifikatori
Aliasi	MRPL13
Vanjski ID-jevi	OMIM: 610200 MGI: 2137218 HomoloGene: 90894 GeneCards: MRPL13
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 8 (čovjek)
Kraj	120,445,402 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 15 (miš)
Kraj	55,421,144 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• structural constituent of ribosome; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • mRNA binding; • vezivanje sa RNK;
Ćelijska komponenta	• mitochondrial inner membrane; • ribozom; • mitochondrial ribosome; • mitohondrija; • mitochondrial large ribosomal subunit;
Biološki proces	• mitochondrial translational elongation; • mitochondrial translational termination; • Biosinteza bjelančevina; • negative regulation of translation;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	28998
	68537
	ENSG00000172172
	ENSMUSG00000022370
	Q9BYD1
	Q9D1P0
	NM_014078
	NM_026759
	NP_054797
	NP_081035
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Mitohondrijski ribosomski protein L13 je protein koji je kod ljudi kodiran genom MRPL13.^[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 178 aminokiselina, а molekulska težina 20.692 Da.^[6]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MSSFSRAPQQ	WATFARIWYL	LDGKMQPPGK	LAAMASIRLQ	GLHKPVYHAL
SDCGDHVVIM	NTRHIAFSGN	KWEQKVYSSH	TGYPGGFRQV	TAAQLHLRDP
VAIVKLAIYG	MLPKNLHRRT	MMERLHLFPD	EYIPEDILKN	LVEELPQPRK
IPKRLDEYTQ	EEIDAFPRLW	TPPEDYRL

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Sisarski mitohondrijski ribosomski proteini kodirani su jedarnim genima i pomažu u sintezi proteina unutar mitohondrija. Mitohondrijski ribosomi (mitoribosomi) sastoje se od male 28S i velike 39S podjedinice. Procenjuje se da imaju 75% sastava proteina prema rRNK u poređenju sa prokariotskim ribosomima, gde je ovaj odnos obrnut. Druga razlika između mitoribosoma sisarskih i prokariotskih ribosoma je ta što ovi drugi sadrže 5S rRNK. Među različitim vrstama, proteini koji se sastoje od mitoribosoma uveliko se razlikuju po sekvenci, a ponekad i po biohemijskim svojstvima, što sprečava lahko prepoznavanje po homologiji sekvence. Ovaj gen kodira protein podjedinice 39S.

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172172 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022370 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Mitochondrial ribosomal protein L13". Pristupljeno 5. 7. 2017.
^ "UniProt, Q9BYD1" (jezik: engleski). Pristupljeno 20. 9. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Mukhopadhyay R, Ray PS, Arif A, Brady AK, Kinter M, Fox PL (2008). "DAPK-ZIPK-L13a axis constitutes a negative-feedback module regulating inflammatory gene expression". Mol. Cell. 32 (3): 371–82. doi:10.1016/j.molcel.2008.09.019. PMC 2644327. PMID 18995835.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172172 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022370 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: Mitochondrial ribosomal protein L13". Pristupljeno 5. 7. 2017.

[UniProt-6] "UniProt, Q9BYD1" (jezik: engleski). Pristupljeno 20. 9. 2021.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]