NLRP4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NLRP4
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4EWI

Identifikatori
AliasiNLRP4
Vanjski ID-jeviOMIM: 609645 MGI: 1890518 HomoloGene: 75315 GeneCards: NLRP4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za NLRP4
Genomska lokacija za NLRP4
Bend19q13.43Početak55,836,540 bp[1]
Kraj55,881,855 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za NLRP4
Genomska lokacija za NLRP4
Bend7|7 A1Početak6,048,160 bp[2]
Kraj6,108,149 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
ATP binding
Ćelijska komponenta citosol
Biološki proces inflammatory response
regulation of type I interferon production
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_134444

NM_031389

RefSeq (bjelančevina)

NP_604393

NP_113566

Lokacija (UCSC)Chr 19: 55.84 – 55.88 MbChr 7: 6.05 – 6.11 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

NACHT, LRR i PYD protein 4 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NLRP4 sa hromosoma 19.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 994 aminokiseline, a molekulska težina 113.415 Da.[7]

1020304050
MAASFFSDFGLMWYLEELKKEEFRKFKEHLKQMTLQLELKQIPWTEVKKA
SREELANLLIKHYEEQQAWNITLRIFQKMDRKDLCMKVMRERTGYTKTYQ
AHAKQKFSRLWSSKSVTEIHLYFEEEVKQEECDHLDRLFAPKEAGKQPRT
VIIQGPQGIGKTTLLMKLMMAWSDNKIFRDRFLYTFYFCCRELRELPPTS
LADLISREWPDPAAPITEIVSQPERLLFVIDSFEELQGGLNEPDSDLCGD
LMEKRPVQVLLSSLLRKKMLPEASLLIAIKPVCPKELRDQVTISEIYQPR
GFNESDRLVYFCCFFKDPKRAMEAFNLVRESEQLFSICQIPLLCWILCTS
LKQEMQKGKDLALTCQSTTSVYSSFVFNLFTPEGAEGPTPQTQHQLKALC
SLAAEGMWTDTFEFCEDDLRRNGVVDADIPALLGTKILLKYGERESSYVF
LHVCIQEFCAALFYLLKSHLDHPHPAVRCVQELLVANFEKARRAHWIFLG
CFLTGLLNKKEQEKLDAFFGFQLSQEIKQQIHQCLKSLGERGNPQGQVDS
LAIFYCLFEMQDPAFVKQAVNLLQEANFHIIDNVDLVVSAYCLKYCSSLR
KLCFSVQNVFKKEDEHSSTSDYSLICWHHICSVLTTSGHLRELQVQDSTL
SESTFVTWCNQLRHPSCRLQKLGINNVSFSGQSVLLFEVLFYQPDLKYLS
FTLTKLSRDDIRSLCDALNYPAGNVKELALVNCHLSPIDCEVLAGLLTNN
KKLTYLNVSCNQLDTGVPLLCEALCSPDTVLVYLMLAFCHLSEQCCEYIS
EMLLRNKSVRYLDLSANVLKDEGLKTLCEALKHPDCCLDSLCLVKCFITA
AGCEDLASALISNQNLKILQIGCNEIGDVGVQLLCRALTHTDCRLEILGL
EECGLTSTCCKDLASVLTCSKTLQQLNLTLNTLDHTGVVVLCEALRHPEC
ALQVLGLRKTDFDEETQALLTAEEERNPNLTITDDCDTITRVEI

Funkcija[uredi | uredi izvor]

NALP-i su citoplazmatski proteini koji čine potporodicu unutar veće porodice proteina CATERPILLER. Većina kratkih NALP-ova, kao što je NALP4, ima N-terminal pirin (MEFV; MIM 608107) domen (PYD), praćen NACHT domenom, NACHT-povezanom domenom (NAD) i C-terminalni region ponavljanja bogatog leucinom (LRR).

Dugi NALP, NALP1 (MIM 606636), takođe ima ekstenziju C-terminala koja sadrži funkciju za pronalaženje domena (FIIND) i kaspaza regrutirajući domen (CARD). NALP su uključeni u aktivaciju proopalnih kaspaza (npr. CASP1; MIM 147678) kroz njihovo učešće u multiproteinskim kompleksima zvanim Inflamasomi (Tschopp et al., 2003), prema OMIM.[7]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160505 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034690 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (Feb 2003). "NALPs: a novel protein family involved in inflammation". Nat Rev Mol Cell Biol. 4 (2): 95–104. doi:10.1038/nrm1019. PMID 12563287. S2CID 31417018.
  6. ^ Wang L, Manji GA, Grenier JM, Al-Garawi A, Merriam S, Lora JM, Geddes BJ, Briskin M, DiStefano PS, Bertin J (Aug 2002). "PYPAF7, a novel PYRIN-containing Apaf1-like protein that regulates activation of NF-kappa B and caspase-1-dependent cytokine processing". J Biol Chem. 277 (33): 29874–80. doi:10.1074/jbc.M203915200. PMID 12019269.
  7. ^ a b c "Entrez Gene: NLRP4 NLR family, pyrin domain containing 4".

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Šablon:NOD-likik receptori