Idi na sadržaj

OTUD1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
OTUD1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4BOP

Identifikatori
AliasiOTUD1
Vanjski ID-jeviOMIM: 612022 MGI: 1918448 HomoloGene: 45953 GeneCards: OTUD1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za OTUD1
Genomska lokacija za OTUD1
Bend10p12.2Početak23,439,075 bp[1]
Kraj23,442,377 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za OTUD1
Genomska lokacija za OTUD1
Bend2|2 A3Početak19,662,563 bp[2]
Kraj19,665,394 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001145373

NM_027715

RefSeq (bjelančevina)

NP_001138845

NP_081991

Lokacija (UCSC)Chr 10: 23.44 – 23.44 MbChr 2: 19.66 – 19.67 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

OTU deubikvitinaza 1je protein koji je kod ljudi kodiran genom OTUD1.[5]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je481 aminokiselina, а molekulska težina 51.063 Da.[6]

1020304050
MQLYSSVCTHYPAGAPGPTAAAPAPPAAATPFKVSLQPPGAAGAAPEPET
GECQPAAAAEHREAAAVPAAKMPAFSSCFEVVSGAAAPASAAAGPPGASC
KPPLPPHYTSTAQITVRALGADRLLLHGPDPVPGAAGSAAAPRGRCLLLA
PAPAAPVPPRRGSSAWLLEELLRPDCPEPAGLDATREGPDRNFRLSEHRQ
ALAAAKHRGPAATPGSPDPGPGPWGEEHLAERGPRGWERGGDRCDAPGGD
AARRPDPEAEAPPAGSIEAAPSSAAEPVIVSRSDPRDEKLALYLAEVEKQ
DKYLRQRNKYRFHIIPDGNCLYRAVSKTVYGDQSLHRELREQTVHYIADH
LDHFSPLIEGDVGEFIIAAAQDGAWAGYPELLAMGQMLNVNIHLTTGGRL
ESPTVSTMIHYLGPEDSLRPSIWLSWLSNGHYDAVFDHSYPNPEYDNWCK
QTQVQRKRDEELAKSMAISLSKMYIEQNACS

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Deubikvitinirajući enzimi (DUB; vidi MIM 603478) su proteaze koje specifično cijepaju veze ubikvitina (MIM 191339), negirajući djelovanje ubikvitinskih ligaza. DUBA7 pripada potporodici DUB koju karakterizira domen tumora jajnika (OTU).

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165312 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000043415 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: OTU deubiquitinase 1". Pristupljeno 13. 3. 2016.
  6. ^ "UniProt, Q5VV17". Pristupljeno 3. 9. 2021.

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]
  • PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human OTU domain-containing protein 1