Idi na sadržaj

PTOV1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
PTOV1
Identifikatori
AliasiPTOV1
Vanjski ID-jeviOMIM: 610195 MGI: 1933946 HomoloGene: 9687 GeneCards: PTOV1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za PTOV1
Genomska lokacija za PTOV1
Bend19q13.33Početak49,850,735 bp[1]
Kraj49,860,744 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za PTOV1
Genomska lokacija za PTOV1
Bend7 B3|7Početak44,512,491 bp[2]
Kraj44,519,212 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001305105
NM_001305108
NM_017432
NM_001364745
NM_001364747

NM_001364748
NM_001364749
NM_001364750
NM_001394010

NM_133949

RefSeq (bjelančevina)
NP_001292034
NP_001292037
NP_059128
NP_001351674
NP_001351676

NP_001351677
NP_001351678
NP_001351679

NP_598710

Lokacija (UCSC)Chr 19: 49.85 – 49.86 MbChr 7: 44.51 – 44.52 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Prekomjerno eksprimirani protein 1 tumora prostateje protein koji je kod ljudi kodiran genom PTOV1.[5][6][7]

Benedit et al. (2001.) utvrdili su da gen PTOV1 sadrži 12 egzona.[8]

Kloniranje i ekspresija

[uredi | uredi izvor]

Koristeći diferencijalni prikaz za identifikaciju gena povećanih u tumorima prostate, praćene analizom baze podataka i RT-PCR, Benedit et al. (2001) klonirali su PTOV1. Izvedeni protein od 416 aminokiselina sastoji se gotovo u potpunosti od dva tandemski poredana bloka koja dijele 66% identiteta i pridruženi su kratkom veznom sekvencom. Predviđalo se da PTOV1 formira naizmjenične alfa-helikse i beta-listove. Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,8 kb obilno izražen u mozgu, srcu, skeletnim mišićima, bubrezima i jetri. Normalna prostata eksprimira nizak nivo PTOV1. Western blot analizom tkiva tumora prostate otkriven je PTOV1 pri prividnoj molekulskoj masi od 58 kD. Imunocitohemijska analiza otkrila je endogeni PTOV1 u citoplazmi, koncentriran oko jedra.

Funkcija gena

[uredi | uredi izvor]

Benedit et al. (2001.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u devet ili 11 uzoraka tumora prostate. Bio je izrazito prekomjerno izražen u žarištima tumora prostate sa malignom morfologijom i bio je povišen umjeren, ali s homogenom raspodjelom, u morfološki normalnim ćelijama smještenim u benignim perifernim zonama istih tumora. U ćelijskoj liniji karcinoma prostate kod ljudi, ekspresija PTOV1 povećala se nakon izlaganja 5-alfa-dihidroksistestosteronu.

Imunohistokemijskom analizom, Santamaria et al. (2003.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u 71% od 38 karcinoma prostate i u 80% uzoraka s intraepitelnom neoplazijom prostate. Visoki nivoi PTOV1 u tumorima značajno koreliraju sa proliferativnim indeksom i lokalizacijom PTOV1 u jedru. U mirno kultiviranim stanicama tumora prostate, PTOV1 se lokalizirao u citoplazmi i izuzeo se iz jedara. Nakon serumske stimulacije, PTOV1 se djelimično translocirao u jedto, na početku S faze. Na kraju mitoze, PTOV1 je izašao iz jedra. Privremena transfekcija PTOV1 fluorescentno označenog prisilnog ulaska ćelija u S-fazi i povećana ekspresija ciklina D1 (CCND1).

Santamaria i et al. (2005.) otkrili su da je PTOV1 stupio u interakciju s lipidnim prenosnim proteinom flotilinom-1 (FLOT1) u frakcijama nerastvorljivih u deterdžentu. Flotillin-1 se kolokalizirao s PTOV1 na plazmamembrani i u jedru, a ušao je u njega istovremeno s PTOV1, malo prije pokretanja S faze. Tokom ćelijskog ciklusa, razine proteina PTOV1 i flotilin-1 su oscilirale, sa vrhuncem u S-fazi. Iscrpljivanje PTOV1 značajno je inhibiralo jedarnu lokalizaciju flotilina-1, dok iscrpljivanje flotillina-1 nije na to uticalo. Iscrpljivanje bilo kojeg proteina izrazito je inhibiralo proliferaciju ćelija u baznim uvjetima. Prekomjerna ekspresija PTOV1 ili flotilin-1 snažno je inducirala proliferaciju, koja je zahtijevala njihovu lokalizaciju u jedru i ovisila je o recipročnom proteinu. Santamaria i et al. (2005.) zaključili su da PTOV1 pomaže flotilinu-1 u njegovoj translokaciji u jedru i da su oba proteina potrebna za proliferaciju ćelija.[9][10]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]
Simboli
1020304050
MVRPRRAPYRSGAGGPLGGRGRPPRPLVVRAVRSRSWPASPRGPQPPRIR
ARSAPPMEGARVFGALGPIGPSSPGLTLGGLAVSEHRLSNKLLAWSGVLE
WQEKRRPYSDSTAKLKRTLPCQAYVNQGENLETDQWPQKLIMQLIPQQLL
TTLGPLFRNSQLAQFHFTNRDCDSLKGLCRIMGNGFAGCMLFPHISPCEV
RVLMLLYSSKKKIFMGLIPYDQSGFVSAIRQVITTRKQAVGPGGVNSGPV
QIVNNKFLAWSGVMEWQEPRPEPNSRSKRWLPSHVYVNQGEILRTEQWPR
KLYMQLIPQQLLTTLVPLFRNSRLVQFHFTKDLETLKSLCRIMDNGFAGC
VHFSYKASCEIRVLMLLYSSEKKIFIGLIPHDQGNFVNGIRRVIANQQQV
LQRNLEQEQQQRGMGG

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104960 - Ensembl, maj 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038502 - Ensembl, maj 2017
  3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Santamaria A, Fernandez PL, Farre X, Benedit P, Reventos J, Morote J, Paciucci R, Thomson TM (Feb 2003). "PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle". Am J Pathol. 162 (3): 897–905. doi:10.1016/S0002-9440(10)63885-0. PMC 1868092. PMID 12598323.
  6. Santamaria A, Castellanos E, Gomez V, Benedit P, Renau-Piqueras J, Morote J, Reventos J, Thomson TM, Paciucci R (Feb 2005). "PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts". Mol Cell Biol. 25 (5): 1900–11. doi:10.1128/MCB.25.5.1900-1911.2005. PMC 549350. PMID 15713644.
  7. "Entrez Gene: PTOV1 prostate tumor overexpressed gene 1".
  8. Benedit, P., Paciucci, R., Thomson, T. M., Valeri, M., Nadal, M., Caceres, C., de Torres, I., Estivill, X., Lozano, J. J., Morote, J., Reventos, J. PTOV1, a novel protein overexpressed in prostate cancer containing a new class of protein homology blocks. Oncogene 20: 1455-1464, 2001. [PubMed]: 11313889
  9. Santamaria, A., Castellanos, E., Gomez, V., Benedit, P., Renau-Piqueras, J., Morote, J., Reventos, J., Thomson, T. M., Paciucci, R. PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts. Molec. Cell. Biol. 25: 1900-1911, 2005. [PubMed]: 15713644
  10. Santamaria, A., Fernandez, P. L., Farre, X., Benedit, P., Reventos, J., Morote, J., Paciucci, R., Thomson, T. M. PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle. Am. J. Path. 162: 897-905, 2003. [PubMed]: 12598323

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]