ERICH2
| ERICH2 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | ERICH2 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | MGI: 1913998 HomoloGene: 75226 GeneCards: ERICH2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | n/a | Chr 2: 70.34 – 70.37 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Protein 1 sa domenom FAST kinaze jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FASTKD1 sa hromosoma 2.[4][5] Ovaj protein dio je porodice FASTKD, poznate po reguriranju energetskog balansa mitohondrija pod stresom.[6] FASTKD1 je takpđer also RNK-vezujući protein koji se povezuje sa kancerom endometrija.[7][8]
Amiokiselininska sekvenca[uredi | uredi izvor]
Dužina polipeptidnog lanca je 847 aminokiselina, a molekulska težina 97.411 Da.[9]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MKKTPVFLES | LVTNMLRLRA | ICPFSWRVFQ | FRPISCEPLI | IQMNKCTDEE | ||||
| QMFGFIERNK | AILSEKQVGC | AFDMLWKLQK | QKTSLLKNAE | YVRDHPQFLT | ||||
| LHNLATNKFK | LMNDDTLVNV | LYVTQQFAGE | AHDPLVEALV | TEAWRRLERF | ||||
| DIKLLSEFSS | CLADQHLYFS | PLMGKIADIV | HRNLETTQDL | SSLSVLMVNI | ||||
| SSLISRHFQQ | QLVNKTELLF | DTIDSSEVNV | AKSIAKFLRN | VRYRYQPLLE | ||||
| RCNNVFLSNV | DHLDLDSISK | ILSVYKFLQF | NSFEFIIMAK | KKLTEMIPLC | ||||
| NHPASFVKLF | VALGPIAGPE | EKKQLKSTML | LMSEDLTGEQ | ALAVLGAMGD | ||||
| MESRNSCLIK | RVTSVLHKHL | DGYKPLELLK | ITQELTFLHF | QRKEFFAKLR | ||||
| ELLLSYLKNS | FIPTEVSVLV | RAISLLPSPH | LDEVGISRIE | AVLPQCDLNN | ||||
| LSSFATSVLR | WIQHDHMYLD | NMTAKQLKLL | QKLDHYGRQR | LQHSNSLDLL | ||||
| RKELKSLKGN | TFPESLLEEM | IATLQHFMDD | INYINVGEIA | SFISSTDYLS | ||||
| TLLLDRIASV | AVQQIEKIHP | FTIPAIIRPF | SVLNYDPPQR | DEFLGTCVQH | ||||
| LNSYLGILDP | FILVFLGFSL | ATLEYFPEDL | LKAIFNIKFL | ARLDSQLEIL | ||||
| SPSRSARVQF | HLMELNRSVC | LECPEFQIPW | FHDRFCQQYN | KGIGGMDGTQ | ||||
| QQIFKMLAEV | LGGINCVKAS | VLTPYYHKVD | FECILDKRKK | PLPYGSHNIA | ||||
| LGQLPEMPWE | SNIEIVGSRL | PPGAERIALE | FLDSKALCRN | IPHMKGKSAM | ||||
| KKRHLEILGY | RVIQISQFEW | NSMALSTKDA | RMDYLRECIF | GEVKSCL |
Struktura[uredi | uredi izvor]
FASTKD1 dijeli strukturne karakteristike porodice FASTKD, uključujući N-terminal mitohoddrijskog ciljajućeg domena i tri C-terminalna domena: dva slična domenu FAST kinaze (FAST_1 i FAST_2) i RNK-vezujući domen (RAP).[6][10] Mitohondrijski domen ciljanja usmjerava FASTKD1 na unos u mitohondrije. Iako su funkcije C-terminalnih domena nepoznate, RAP se vjerovatno vezuje za RNK tokom trans-splajsinga.[6]
Funkcija[uredi | uredi izvor]
Kao član porodice FASTKD, FASTKD1 nalazi se na mitohondrijama, kako bi modulirao njihov energetski balans, posebno u uslovima stresa. Iako je sveprisutno izražen u svim tkivima, FASTKD1 se pojavljuje u većoj količini u skeletnim i srčnom mišiću i drugim tkivima obogaćenim mitohondrijima.[6] FASTKD1 has been validated as an RNA-binding protein.[7][11]
Klinički značaj[uredi | uredi izvor]
FASTKD1 je važan apoptotski sastojak. Tokom normalnih embrioloških procesa, ili tokom povrede ćelije (kao što je ishemijsko-reperfuziona povreda tokom srčanog i moždanog udara) ili tokom razvoja i procesa u kancerima, apoptotska ćelija podvrgava se strukturnim promjenama, uključujući skupljanje ćelije, vezikule plazmamembrane, jedarnu kondenzaciju i fragmentaciju DNK i jedra. Nakon toga slijedi fragmentacija u apoptotska tijela koja se brzo uklanjaju fagociti, čime se sprečava upalni odgovor.[12] To je način ćelijske smrti definiran karakterističnim morfološkim, biohemijskim i molekulnim promjenama. Prvo je opisana kao "nekroza skupljanja", a zatim je ovaj termin zamijenjen sa apoptoza, kako bi se naglasila njegova uloga suprotna mitozama u kinetici tkiva. U kasnijim fazama apoptoze, cijela ćelija postaje fragmentirana, formirajući niz apoptotskih tijela ograničenih plazmamembranom koja sadrže jedarne i/ili citoplazmatske elemente. Ultrastrukturni izgled nekroza je prilično drugačiji, a glavne karakteristike su oticanje mitohondrija, slom plazmamembrane i ćelijska dezintegracija. Apoptoza se javlja u mnogim fiziološkim i patološkim procesima. Ima važnu ulogu tokom embrionskog razvoja kao programirana ćelijska smrt i prati niz normalnih involucijskih procesa u kojima služi kao mehanizam za uklanjanje "neželjenih" ćelija.
FASTKD1 je identificiran kao potencijalni molekulni biomarker za karcinom endometrija, karcinom ženskog genitalnog trakta, prvenstveno korištenjem aspirata maternice.[8] Ovaj nalaz predstavlja osnovu za razvoj visoko osjetljive i specifične minimalno invazivne metode za skrininga karcinoma endometrija. Shodno tome, skrining genske ekspresije obavljen je na 52 uzorka karcinoma i serija kvantitativne PCR-validacije u realnom vremenu na 19 uparenih karcinoma i uzoraka normalnog tkiva i na 50 aspirata karcinoma i nekarcinoma uterusaa, kako bi se identificirli i potvrdili potencijalne biomarkere karcinoma endometrija.[8] Nadalje, druga studija je osmislila strategiju za istraživanje potpisa genske ekspresije povezane s preživljavanjem u akutnoj limfoblastnoj leukemiju (ALL), za traženje aberantne aktivnosti gena, koja se sastoji od primjene nekoliko filtera na transkriptomske skupove podataka iz dvije pedijatrijske ALL studije. Identificirano je šest gena čija je ekspresija u leukemijskim BLAST-ima povezana s prognozom: tri gena koja predviđaju lošu prognozu (AK022211, FASTKD1 i STARD4) i tri gena povezana sa povoljnim ishodom (CAMSAP1 , PCGF6 i SH3RF3). Stoga se čini da FASTKD1 također može imti ulogu u ALL.[13]
Reference[uredi | uredi izvor]
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000075302 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "FAST kinase domains 1".
- ^ "Entrez Gene: FAST kinase domains 1".
- ^ a b c d Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (Oct 2010). "Fast kinase domain-containing protein 3 is a mitochondrial protein essential for cellular respiration". Biochemical and Biophysical Research Communications. 401 (3): 440–6. doi:10.1016/j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
- ^ a b Castello A, Fischer B, Eichelbaum K, Horos R, Beckmann BM, Strein C, Davey NE, Humphreys DT, Preiss T, Steinmetz LM, Krijgsveld J, Hentze MW (Jun 2012). "Insights into RNA biology from an atlas of mammalian mRNA-binding proteins". Cell. 149 (6): 1393–406. doi:10.1016/j.cell.2012.04.031. PMID 22658674.
- ^ a b c Colas E, Perez C, Cabrera S, Pedrola N, Monge M, Castellvi J, Eyzaguirre F, Gregorio J, Ruiz A, Llaurado M, Rigau M, Garcia M, Ertekin T, Montes M, Lopez-Lopez R, Carreras R, Xercavins J, Ortega A, Maes T, Rosell E, Doll A, Abal M, Reventos J, Gil-Moreno A (Nov 2011). "Molecular markers of endometrial carcinoma detected in uterine aspirates". International Journal of Cancer. 129 (10): 2435–44. doi:10.1002/ijc.25901. PMID 21207424. S2CID 11956280.
- ^ "UniProt, Q53R41" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 11. 2021.
- ^ Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (Jun 2011). "A novel transcription complex that selectively modulates apoptosis of breast cancer cells through regulation of FASTKD2". Molecular and Cellular Biology. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128/MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.
- ^ Baltz AG, Munschauer M, Schwanhäusser B, Vasile A, Murakawa Y, Schueler M, Youngs N, Penfold-Brown D, Drew K, Milek M, Wyler E, Bonneau R, Selbach M, Dieterich C, Landthaler M (Jun 2012). "The mRNA-bound proteome and its global occupancy profile on protein-coding transcripts". Molecular Cell. 46 (5): 674–90. doi:10.1016/j.molcel.2012.05.021. PMID 22681889.
- ^ Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (Aug 1972). "Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics". British Journal of Cancer. 26 (4): 239–57. doi:10.1038/bjc.1972.33. PMC 2008650. PMID 4561027.
- ^ Wang J, Mi JQ, Debernardi A, Vitte AL, Emadali A, Meyer JA, Charmpi K, Ycart B, Callanan MB, Carroll WL, Khochbin S, Rousseaux S (Jun 2015). "A six gene expression signature defines aggressive subtypes and predicts outcome in childhood and adult acute lymphoblastic leukemia". Oncotarget. 6 (18): 16527–42. doi:10.18632/oncotarget.4113. PMC 4599287. PMID 26001296.