NLRP1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NLRP1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1PN5, 3KAT, 4IFP, 4IM6

Identifikatori
AliasiNLRP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 GeneCards: NLRP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za NLRP1
Genomska lokacija za NLRP1
Bend17p13.2Početak5,499,427 bp[1]
Kraj5,619,424 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za NLRP1
Genomska lokacija za NLRP1
Bend11|11 B4Početak71,043,928 bp[2]
Kraj71,121,559 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein domain specific binding
nucleotide binding
cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
ATP binding
vezivanje enzima
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
Inflamasom
jedro
intracellular anatomical structure
nukleoplazma
citosol
NLRP1 inflammasome complex
Biološki proces neuron apoptotic process
regulation of apoptotic process
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
response to muramyl dipeptide
GO:0097285 apoptoza
defense response to bacterium
regulation of inflammatory response
immune system process
inflammatory response
Urođeni imunski sistem
GO:0022415 viral process
NLRP1 inflammasome complex assembly
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq (bjelančevina)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_001155886

Lokacija (UCSC)Chr 17: 5.5 – 5.62 MbChr 11: 71.04 – 71.12 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

NLRP1 je protein koji ljudi kodira NACHT, LRR, FIIND, CARD domen i protein 1 sa domenima PYD sa hromosoma 17[5][6][7] NLRP1 je bio prvi protein za koji je pokazano da formira inflamasom.[8] NLRP1 se eksprimira u raznim tipovima ćelija, koji su pretežno epitelne ili hematopoetske. Ekspresija se također vidi unutar žljezdanih epitelnih struktura uključujući sluznicu tankog crijeva, želuca, epitel dišnih puteva i u koži bez dlake ili goloj koži.[9] > NLRP1 polimorfizmi su povezani sa kožnim ekstra-intestinalnim manifestacijama u CD-u.[9] Njegova najveća ekspresija je otkrivena u ljudskoj koži, psorijazi i vitiligu. Polimorfizmi NLRP1 pronađeni su kod lupus erythematosus i dijabetesa tipa 1.[10] Utvrđeno je da se varijante mišjeg NLRP1 aktiviraju nakon cijepanja N-terminala pomoću smrtonosnog faktora proteaza u antraksu.[8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.473 aminokiseline, a molekulska težina 165.866 Da.[7]

1020304050
MAGGAWGRLACYLEFLKKEELKEFQLLLANKAHSRSSSGETPAQPEKTSG
MEVASYLVAQYGEQRAWDLALHTWEQMGLRSLCAQAQEGAGHSPSFPYSP
SEPHLGSPSQPTSTAVLMPWIHELPAGCTQGSERRVLRQLPDTSGRRWRE
ISASLLYQALPSSPDHESPSQESPNAPTSTAVLGSWGSPPQPSLAPREQE
APGTQWPLDETSGIYYTEIREREREKSEKGRPPWAAVVGTPPQAHTSLQP
HHHPWEPSVRESLCSTWPWKNEDFNQKFTQLLLLQRPHPRSQDPLVKRSW
PDYVEENRGHLIEIRDLFGPGLDTQEPRIVILQGAAGIGKSTLARQVKEA
WGRGQLYGDRFQHVFYFSCRELAQSKVVSLAELIGKDGTATPAPIRQILS
RPERLLFILDGVDEPGWVLQEPSSELCLHWSQPQPADALLGSLLGKTILP
EASFLITARTTALQNLIPSLEQARWVEVLGFSESSRKEYFYRYFTDERQA
IRAFRLVKSNKELWALCLVPWVSWLACTCLMQQMKRKEKLTLTSKTTTTL
CLHYLAQALQAQPLGPQLRDLCSLAAEGIWQKKTLFSPDDLRKHGLDGAI
ISTFLKMGILQEHPIPLSYSFIHLCFQEFFAAMSYVLEDEKGRGKHSNCI
IDLEKTLEAYGIHGLFGASTTRFLLGLLSDEGEREMENIFHCRLSQGRNL
MQWVPSLQLLLQPHSLESLHCLYETRNKTFLTQVMAHFEEMGMCVETDME
LLVCTFCIKFSRHVKKLQLIEGRQHRSTWSPTMVVLFRWVPVTDAYWQIL
FSVLKVTRNLKELDLSGNSLSHSAVKSLCKTLRRPRCLLETLRLAGCGLT
AEDCKDLAFGLRANQTLTELDLSFNVLTDAGAKHLCQRLRQPSCKLQRLQ
LVSCGLTSDCCQDLASVLSASPSLKELDLQQNNLDDVGVRLLCEGLRHPA
CKLIRLGLDQTTLSDEMRQELRALEQEKPQLLIFSRRKPSVMTPTEGLDT
GEMSNSTSSLKRQRLGSERAASHVAQANLKLLDVSKIFPIAEIAEESSPE
VVPVELLCVPSPASQGDLHTKPLGTDDDFWGPTGPVATEVVDKEKNLYRV
HFPVAGSYRWPNTGLCFVMREAVTVEIEFCVWDQFLGEINPQHSWMVAGP
LLDIKAEPGAVEAVHLPHFVALQGGHVDTSLFQMAHFKEEGMLLEKPARV
ELHHIVLENPSFSPLGVLLKMIHNALRFIPVTSVVLLYHRVHPEEVTFHL
YLIPSDCSIRKAIDDLEMKFQFVRIHKPPPLTPLYMGCRYTVSGSGSGML
EILPKELELCYRSPGEDQLFSEFYVGHLGSGIRLQVKDKKDETLVWEALV
KPGDLMPATTLIPPARIAVPSPLDAPQLLHFVDQYREQLIARVTSVEVVL
DKLHGQVLSQEQYERVLAENTRPSQMRKLFSLSQSWDRKCKDGLYQALKE
THPHLIMELWEKGSKKGLLPLSS

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira člana Ced-4 porodice apoptoznih proteina. Članovi Ced porodice sadrže domen regrutacije kaspaze (CARD) i poznato je da su ključni posrednici programirane ćelijske smrti. Kodirani protein sadrži poseban N-terminalni pirin-oliki motiv, koji je možda uključen u interajcije protein-protein. Protein NLRP1 snažno reaguje sa kaspazom 2 i slabo sa kaspazom 9. Pokazalo se da prekomjerna ekspresija ovog gena u ćelijama izaziva piroptozu. Višestruke alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme su pronađene za ovaj gen, ali biološka valjanost nekih varijanti nije utvrđena.[7]

Mehanizam aktivacije[uredi | uredi izvor]

NLRP1 aktivira antibakterijski ili antivirusni imunski odgovor. Antibakterijski imunski odgovor nadoknađuje gubitak MAP kinaznog odgovora. Ljudi proizvode NLRP1, ali ljudski NLRP1 nije aktiviran smrtonosnim faktorom.[8] NLRP1 bi se mogao aktivirati proteoliskim cijepanjem, što rezultira uklanjanjem autoinhibitornog PYD i oslobađanjem CARD domena, odgovornog za regrutovanje i aktivacija prokapaze-1 u aktivnom obliku kaspaze-1.[8] Ljudska aktivacija NLRP1 može se izazvati na nekoliko načina uključujući enterovirusnu 3C- proteaze.[11] njegov funkdcija je u munsti tek je počela da se shvata.[8]

Interakcije[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da NLRP1 reaguje sa kaspazom 9[12][13] i APAF1.[12] Preko svog FIIND domena, NLRP1 je u direktnoj interakciji sa DPP9 i DPP8, koji su potrebni za sprečavanje aktivacije NLRP1.[14]

Gubitak DPP9 kod ljudi i miševa dovodi do aktivacije NLRP1.[15]

Varijante NLRP1 kod ljudi[uredi | uredi izvor]

Kako su objavili Bruno Reversade i kolege, opisano je nekoliko mendelovskih bolesti uzrokovanih mutacijama zametne linije NLRP1.[16] To uključuje višestruki samoizlječivi palmoplantarni karcinom, porodičnu Nikamovu bolest i autoupaluđu s artritisom i diskeratozom. Mutacije u NLRP1, bilo da su dominantne ili recesivne, imaju tendenciju da budu aleli pojačanja funkcije koji pokreću inflamasomnu signalizaciju sa IL1B i IL18.

Varijante NLRP1 kod miševa[uredi | uredi izvor]

Miševi imaju tri paraloga gena Nlrp1 (Nlrp1a, b, c). Nlrp1c je pseudogen.[17] Mišji NLRP1B se ne aktivira mehanizmom tipa receptor-ligand. NLRP1B varijante određenih inbred sojeva miševa, BALB/c i 129, mogu se aktivirati smrtonosnim faktorom (LF) proteaza. Smrtonosni faktor proteaza proizvodi i luči Bacillus anthracis, agens antraksa.[18] Zajedno sa zaštitnim antigenom (PA), LF formira bipartitni toksin, smrtonosni toksin. Uloga PA je da formira hromosomski translocacijski kanal koji isporučuje LF u citosol ćelije domaćina gdje LF ima ulogu u imunskom odgovoru, cijepanjem i inaktivacijom MAP kinaza.[19][20] LF takođe direktno ciepa NLRP1B proksimalno do njegovog N-terminala, što je neophodno i dovoljno za formiranje NLRP1B inflamasoma i aktivaciju CASP1.[21] Aktivacija NLRP1B-ovisnih inflamafomskih odgovora pojavljuje se u odbrani domaćina s mehanizmom poput IL-1β i neutrofila.[22][23] NLRP1B može funkcionirati kao senzor bakterijskih proteaza, imunski odgovori su specifično aktivirani faktorima virulencija.[24][25]

Nije jasno koji bi stimulansi mogli aktivirati NLRP1A, drugi poznati funkcionalni mišji paralog NLRP1. Studija je identifikovala miša koji je nosio misens mutacijsko pojačanje funkcije u NLRP1A (Q593P) koji aktivira inflamasomne odgovore. Mehanizam aktivacije divljeg tips NLRP1A ---nije jasan.[26]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000091592 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000070390 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Beck S (Oct 1996). "Phylogeny and structure of the RING3 gene". Immunogenetics. 44 (5): 391–6. doi:10.1007/BF02602785. PMID 8781126. S2CID 44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (februar 2003). "NALPs: a novel protein family involved in inflammation". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 4 (2): 95–104. doi:10.1038/nrm1019. PMID 12563287. S2CID 31417018.
  7. ^ a b c "Entrez Gene: NLRP1 NLR family, pyrin domain containing 1".
  8. ^ a b c d e Chavarría-Smith J, Mitchell PS, Ho AM, Daugherty MD, Vance RE (decembar 2016). "Functional and Evolutionary Analyses Identify Proteolysis as a General Mechanism for NLRP1 Inflammasome Activation". PLOS Pathogens. 12 (12): e1006052. doi:10.1371/journal.ppat.1006052. PMC 5142783. PMID 27926929. Materijal je kopiran iz ovog izvora, koji je dostupan na linku Creative Commons Attribution 4.0 International License. Greška kod citiranja: Neispravna oznaka <ref>; naziv ":0" definiran je nekoliko puta s različitim sadržajem
  9. ^ a b Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L, Kuijk L, Martinon F, et al. (maj 2007). "Inflammasome components NALP 1 and 3 show distinct but separate expression profiles in human tissues suggesting a site-specific role in the inflammatory response". The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 55 (5): 443–52. doi:10.1369/jhc.6A7101.2006. PMID 17164409.
  10. ^ Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C, et al. (juli 2017). "NLRP1-associated autoinflammation with arthritis and dyskeratosis)". Annals of the Rheumatic Diseases. 76 (7): 1191–1198. doi:10.1136/annrheumdis-2016-210021. PMID 27965258. S2CID 206852426.
  11. ^ Robinson KS, Teo DE, Tan KS, Toh GA, Ong HH, Lim CK, et al. (decembar 2020). "Enteroviral 3C protease activates the human NLRP1 inflammasome in airway epithelia". Science. 370 (6521): eaay2002. doi:10.1126/science.aay2002. PMID 33093214. S2CID 225052810.
  12. ^ a b Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, et al. (mart 2001). "A novel enhancer of the Apaf1 apoptosome involved in cytochrome c-dependent caspase activation and apoptosis". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9239–45. doi:10.1074/jbc.M006309200. PMID 11113115.
  13. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, et al. (mart 2001). "Molecular cloning and characterization of DEFCAP-L and -S, two isoforms of a novel member of the mammalian Ced-4 family of apoptosis proteins". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9230–8. doi:10.1074/jbc.M009853200. PMID 11076957.
  14. ^ Zhong FL, Robinson K, Teo DE, Tan KY, Lim C, Harapas CR, et al. (decembar 2018). "Human DPP9 represses NLRP1 inflammasome and protects against autoinflammatory diseases via both peptidase activity and FIIND domain binding". The Journal of Biological Chemistry. 293 (49): 18864–18878. doi:10.1074/jbc.RA118.004350. PMC 6295727. PMID 30291141.
  15. ^ Harapas CR, Robinson KS, Lay K, Wong J, Moreno Traspas R, Nabavizadeh N, et al. (3. 2. 2021). "DPP9 deficiency: an Inflammasomopathy which can be rescued by lowering NLRP1/IL-1 signaling". medRxiv. doi:10.1101/2021.01.31.21250067. S2CID 231775569.
  16. ^ Zhong FL, Mamaï O, Sborgi L, Boussofara L, Hopkins R, Robinson K, et al. (septembar 2016). "Germline NLRP1 Mutations Cause Skin Inflammatory and Cancer Susceptibility Syndromes via Inflammasome Activation". Cell. 167 (1): 187–202.e17. doi:10.1016/j.cell.2016.09.001. PMID 27662089.
  17. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (mart 2013). "Transcriptional analysis of the three Nlrp1 paralogs in mice". BMC Genomics. 14 (1): 188. doi:10.1186/1471-2164-14-188. PMC 3641005. PMID 23506131.
  18. ^ Boyden ED, Dietrich WF (februar 2006). "Nalp1b controls mouse macrophage susceptibility to anthrax lethal toxin". Nature Genetics. 38 (2): 240–4. doi:10.1038/ng1724. PMID 16429160. S2CID 23316987.
  19. ^ Turk BE (mart 2007). "Manipulation of host signalling pathways by anthrax toxins". The Biochemical Journal. 402 (3): 405–17. doi:10.1042/BJ20061891. PMID 17313374.
  20. ^ Moayeri M, Leppla SH (decembar 2009). "Cellular and systemic effects of anthrax lethal toxin and edema toxin". Molecular Aspects of Medicine. 30 (6): 439–55. doi:10.1016/j.mam.2009.07.003. PMC 2784088. PMID 19638283.
  21. ^ Chavarría-Smith J, Vance RE (2013). "Direct proteolytic cleavage of NLRP1B is necessary and sufficient for inflammasome activation by anthrax lethal factor". PLOS Pathogens. 9 (6): e1003452. doi:10.1371/journal.ppat.1003452. PMC 3688554. PMID 23818853.
  22. ^ Terra JK, Cote CK, France B, Jenkins AL, Bozue JA, Welkos SL, et al. (januar 2010). "Cutting edge: resistance to Bacillus anthracis infection mediated by a lethal toxin sensitive allele of Nalp1b/Nlrp1b". Journal of Immunology. 184 (1): 17–20. doi:10.4049/jimmunol.0903114. PMC 2811128. PMID 19949100.
  23. ^ Moayeri M, Crown D, Newman ZL, Okugawa S, Eckhaus M, Cataisson C, et al. (decembar 2010). "Inflammasome sensor Nlrp1b-dependent resistance to anthrax is mediated by caspase-1, IL-1 signaling and neutrophil recruitment". PLOS Pathogens. 6 (12): e1001222. doi:10.1371/journal.ppat.1001222. PMC 3000361. PMID 21170303.
  24. ^ de Zoete MR, Bouwman LI, Keestra AM, van Putten JP (mart 2011). "Cleavage and activation of a Toll-like receptor by microbial proteases". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (12): 4968–73. Bibcode:2011PNAS..108.4968D. doi:10.1073/pnas.1018135108. PMC 3064367. PMID 21383168.
  25. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzac C, Sklenar J, et al. (maj 2015). "A Plant Immune Receptor Detects Pathogen Effectors that Target WRKY Transcription Factors". Cell (jezik: engleski). 161 (5): 1089–1100. doi:10.1016/j.cell.2015.04.024. PMID 26000484.
  26. ^ Masters SL, Gerlic M, Metcalf D, Preston S, Pellegrini M, O'Donnell JA, et al. (decembar 2012). "NLRP1 inflammasome activation induces pyroptosis of hematopoietic progenitor cells". Immunity (jezik: engleski). 37 (6): 1009–23. doi:10.1016/j.immuni.2012.08.027. PMC 4275304. PMID 23219391.

Doipunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

Šablon:NOD-liki receptori