CACNA1A

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
(Preusmjereno sa Cav2.1)
CACNA1A
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3BXK

Identifikatori
AliasiCACNA1A
Vanjski ID-jeviOMIM: 601011 MGI: 109482 HomoloGene: 56383 GeneCards: CACNA1A
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za CACNA1A
Genomska lokacija za CACNA1A
Bend19p13.13Početak13,206,442 bp[1]
Kraj13,633,025 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za CACNA1A
Genomska lokacija za CACNA1A
Bend8 C2- C3|8 40.95 cMPočetak85,065,268 bp[2]
Kraj85,366,875 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija metal ion binding
ion channel activity
voltage-gated ion channel activity
syntaxin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
voltage-gated calcium channel activity
calcium channel activity
high voltage-gated calcium channel activity
amyloid-beta binding
Ćelijska komponenta citoplazma
Naponom kontrolirani kalcijev kanal
projekcija ćelije
Jedro
membrana
integral component of membrane
Ćelijska membrana
neuronal cell body
Biološki proces calcium ion transport
Ćelijska smrt
transmembrane transport
membrane depolarization during action potential
regulation of ion transmembrane transport
ion transport
GO:0015915 transport
regulation of insulin secretion
calcium ion transmembrane transport
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
membrane depolarization
chemical synaptic transmission
modulation of chemical synaptic transmission
calcium ion import
response to amyloid-beta
cellular response to amyloid-beta
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_023035
NM_000068
NM_001127221
NM_001127222
NM_001174080

NM_001252059
NM_001252060
NM_001252061
NM_007578

RefSeq (bjelančevina)

NP_000059
NP_001120693
NP_001120694
NP_001167551
NP_075461

NP_001238988
NP_001238989
NP_001238990
NP_031604

Lokacija (UCSC)Chr 19: 13.21 – 13.63 MbChr 8: 85.07 – 85.37 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Cav2.1, znan i kao P/Q, je naponski ovisni kalcijev kanal, koji se uglavnom nalazi u mozgu.[5] Konkretno, nalazi se na predsinapsnim terminalima neurona u mozgu i cerebelumu.[5] Cav2.1 ima važnu ulogu u kontroli oslobađanja neurotransmitera između neurona.[5] Sastoji se od više podjedinica, uključujući alfa-1, beta, alfa-2 / delta i gama podjedinice.[6] Podjedinica alfa-1 je podjedinica koja formira pore, što znači da kroz nju prolaze joni kalcija.[5] Različiti tipovi kalcijevih kanala imaju različite verzije izoformi alfa-1 podjedinice. Cav 2.1 ima alfa-1A podjedinicu,[6] koj je kodirana genom CACNA1A. [a][5] Mutacije u CACNA1A povezane su s različitim neurvnim poremećajima, uključujući porodičnu hemiplegijsku migrenu, epizodnu ataksiju tip 2 i spinocerebelarnu ataksiju tip 6.[5]

Aminokiselinski sastav[uredi | uredi izvor]

1020304050
MARFGDEMPARYGGGGSGAAAGVVVGSGGGRGAGGSRQGGQPGAQRMYKQ
SMAQRARTMALYNPIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITEWPPF
EYMILATIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGI
KIIALGFAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRTLRAVRVL
RPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMG
KFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQ
FDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWNWLYFIPLIIIGSFF
MLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAE
EVILAEDETDGEQRHPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVG
SPFARASIKSAKLENSTFFHKKERRMRFYIRRMVKTQAFYWTVLSLVALN
TLCVAIVHYNQPEWLSDFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSS
FNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIKPGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASL
RNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGQFNFDEGTPPTN
FDTFPAAIMTVFQILTGEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLF
GNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKDEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVS
PLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEMRKQNLLASREALYNEMDP
DERWKAAYTRHLRPDMKTHLDRPLVVDPQENRNNNTNKSRAAEPTVDQRL
GQQRAEDFLRKQARYHDRARDPSGSAGLDARRPWAGSQEAELSREGPYGR
ESDHHAREGSLEQPGFWEGEAERGKAGDPHRRHVHRQGGSRESRSGSPRT
GADGEHRRHRAHRRPGEEGPEDKAERRARHREGSRPARGGEGEGEGPDGG
ERRRRHRHGAPATYEGDARREDKERRHRRRKENQGSGVPVSGPNLSTTRP
IQQDLGRQDPPLAEDIDNMKNNKLATAESAAPHGSLGHAGLPQSPAKMGN
STDPGPMLAIPAMATNPQNAASRRTPNNPGNPSNPGPPKTPENSLIVTNP
SGTQTNSAKTARKPDHTTVDIPPACPPPLNHTVVQVNKNANPDPLPKKEE
EKKEEEEDDRGEDGPKPMPPYSSMFILSTTNPLRRLCHYILNLRYFEMCI
LMVIAMSSIALAAEDPVQPNAPRNNVLRYFDYVFTGVFTFEMVIKMIDLG
LVLHQGAYFRDLWNILDFIVVSGALVAFAFTGNSKGKDINTIKSLRVLRV
LRPLKTIKRLPKLKAVFDCVVNSLKNVFNILIVYMLFMFIFAVVAVQLFK
GKFFHCTDESKEFEKDCRGKYLLYEKNEVKARDREWKKYEFHYDNVLWAL
LTLFTVSTGEGWPQVLKHSVDATFENQGPSPGYRMEMSIFYVVYFVVFPF
FFVNIFVALIIITFQEQGDKMMEEYSLEKNERACIDFAISAKPLTRHMPQ
NKQSFQYRMWQFVVSPPFEYTIMAMIALNTIVLMMKFYGASVAYENALRV
FNIVFTSLFSLECVLKVMAFGILNYFRDAWNIFDFVTVLGSITDILVTEF
GNNFINLSFLRLFRAARLIKLLRQGYTIRILLWTFVQSFKALPYVCLLIA
MLFFIYAIIGMQVFGNIGIDVEDEDSDEDEFQITEHNNFRTFFQALMLLF
RSATGEAWHNIMLSCLSGKPCDKNSGILTRECGNEFAYFYFVSFIFLCSF
LMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHHLDEYVRVWAEYDPAAWGRMPYL
DMYQMLRHMSPPLGLGKKCPARVAYKRLLRMDLPVADDNTVHFNSTLMAL
IRTALDIKIAKGGADKQQMDAELRKEMMAIWPNLSQKTLDLLVTPHKSTD
LTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKLQAMREEQDRTPLMFQRMEPPSPTQEG
GPGQNALPSTQLDPGGALMAHESGLKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSPEQ
GPPTDMPNSQPNSQSVEMREMGRDGYSDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAE
NQRRRGRPRGNNLSTISDTSPMKRSASVLGPKARRLDDYSLERVPPEENQ
RHHQRRRDRSHRASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPSKERDQER
GRPKDRKHRQHHHHHHHHHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSP
SEGREHMAHRQGSSSVSGSPAPSTSGTSTPRRGRRQLPQTPSTPRPHVSY
SPVIRKAGGSGPPQQQQQQQQQQQAVARPGRAATSGPRRYPGPTAEPLAG
DRPPTGGHSSGRSPRMERRVPGPARSESPRACRHGGARWPASGPHVSEGP
PGPRHHGYYRGSDYDEADGPGSGGGEEAMAGAYDAPPPVRHASSGATGRS
PRTPRASGPACASPSRHGRRLPNGYYPAHGLARPRGPGSRKGLHEPYSES
DDDWC
Simboli

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Kalcijski kanali koji zavise od napona posreduju ulasku iona kalcija u pobuđene ćelije, a također su uključeni u razne procese koji zavise od kalcija, uključujući kontrakciju mišića, oslobađanje hormona ili neurotransmitera i ekspresiju gena. Kalcijski kanali su višepodjedinstveni kompleksi sastavljeni od alfa-1, beta, alfa-2/delta i gama podjedinice. Aktivnošću kanala upravlja alfa-1 podjedinica koja formira pore, dok ostale djeluju kao pomoćne podjedinice koje reguliraju ovu aktivnost. Obilježavajuća svojstva tipova kalcijevih kanala povezana su prvenstveno s ekspresijom različitih alfa-1 izoformi, alfa-1A, B, C, D, E i S. Ovaj gen kodira alfa-1A podjedinicu, koja je pretežno eksprimirana u neuronskom tkivu.[6]

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

Mutacije u genu CACNA1A povezane su s višestrukim nervim poremećajima, od kojih su mnogi epizodni, kao što su porodična hemiplegijska migrena, poremećaji pokreta kao što je epizodna ataksija i epilepsija sa više tipova napada.[8]

Ovaj gen također ima polimorfne varijacije zbog (CAG) n-ponavljanja. Za ovaj gen pronađeno je više varijanti transkripta koji kodiraju različite izoformi. U jednom skupu varijanti transkripta, n-ponavljanja (CAG) javljaju se u 3 'UTR i nisu povezane sa bilo kojom bolešću. Međutim, u drugom skupu varijanti, insercija proširuje područje kodiranja tako da uključuje (CAG) n-ponavljanje koje kodira poliglutaminov trakt. Širenje (CAG) n-ponavljanja sa normalnih 4-16 na 21-28 u kodnom području povezano je sa spinocerebelarnom ataksijom 6.[6]

Interakcije[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da Cav2.1 ima interakcije sa CACNB4.[9][10]

Napomene[uredi | uredi izvor]

  1. ^ CACNA1A skraćenica je punog imena gena, CAlcium voltated gated ChaNnel subunit AIpha 1A, što je opis proteina koji je kodiran genom.[7]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141837 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034656 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d e f Sutherland HG, Albury CL, Griffiths LR (21. 6. 2019). "Advances in genetics of migraine". The Journal of Headache and Pain. 20 (1). doi:10.1186/s10194-019-1017-9. PMID 31226929.
  6. ^ a b c d "CACNA1A". Gene. National Center for Biotechnology Information. 16. 3. 2021. Pristupljeno 28. 3. 2021.
  7. ^ "The Science of CACNA1A". CACNA1A Foundation. Pristupljeno 28. 3. 2021.
  8. ^ Papandreou A, Danti FR, Spaull R, Leuzzi V, Mctague A, Kurian MA (februar 2020). "The expanding spectrum of movement disorders in genetic epilepsies". Developmental Medicine and Child Neurology. 62 (2): 178–191. doi:10.1111/dmcn.14407. PMID 31784983. S2CID 208498567.
  9. ^ Walker D, Bichet D, Campbell KP, De Waard M (januar 1998). "A beta 4 isoform-specific interaction site in the carboxyl-terminal region of the voltage-dependent Ca2+ channel alpha 1A subunit". The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2361–7. doi:10.1074/jbc.273.4.2361. PMID 9442082.
  10. ^ Walker D, Bichet D, Geib S, Mori E, Cornet V, Snutch TP, et al. (april 1999). "A new beta subtype-specific interaction in alpha1A subunit controls P/Q-type Ca2+ channel activation". The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12383–90. doi:10.1074/jbc.274.18.12383. PMID 10212211.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]