Kalpain-6

Kalpain-6
Identifikatori
Aliasi	CAPN6
Vanjski ID-jevi	OMIM: 300146 MGI: 1100850 HomoloGene: 7252 GeneCards: CAPN6
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom X Bend Xq23 Početak 111,245,099 bp Kraj 111,270,483 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom X (miš) Bend X|X F2 Početak 142,585,227 bp Kraj 142,610,410 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • microtubule binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Ćelijska komponenta • citoplazma • perinuklearno područje citoplazme • Diobeno vreteno • spindle microtubule • Mikrotubula • intracellular anatomical structure • citoskelet • citosol Biološki proces • regulation of cytoskeleton organization • microtubule bundle formation • Proteoliza Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	827	12338
Ensembl	ENSG00000077274	ENSMUSG00000067276
UniProt	Q9Y6Q1	O35646
RefSeq (mRNK)	NM_014289	NM_007603
RefSeq (bjelančevina)	NP_055104	NP_031629
Lokacija (UCSC)	Chr X: 111.25 – 111.27 Mb	Chr X: 142.59 – 142.61 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Kalpain-6 (znan i kao kalpamodulin) I est protein koji je kod ljudi kodiran genom CAPN6 sa hromosoma X.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 641 aminokiselina, a molekulska težina 74.576 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MGPPLKLFKN		QKYQELKQEC		IKDSRLFCDP		TFLPENDSLF		YNRLLPGKVV
WKRPQDICDD		PHLIVGNISN		HQLTQGRLGH		KPMVSAFSCL		AVQESHWTKT
IPNHKEQEWD		PQKTEKYAGI		FHFRFWHFGE		WTEVVIDDLL		PTINGDLVFS
FSTSMNEFWN		ALLEKAYAKL		LGCYEALDGL		TITDIIVDFT		GTLAETVDMQ
KGRYTELVEE		KYKLFGELYK		TFTKGGLICC		SIESPNQEEQ		EVETDWGLLK
GHTYTMTDIR		KIRLGERLVE		VFSAEKVYMV		RLRNPLGRQE		WSGPWSEISE
EWQQLTASDR		KNLGLVMSDD		GEFWMSLEDF		CRNFHKLNVC		RNVNNPIFGR
KELESVLGCW		TVDDDPLMNR		SGGCYNNRDT		FLQNPQYIFT		VPEDGHKVIM
SLQQKDLRTY		RRMGRPDNYI		IGFELFKVEM		NRKFRLHHLY		IQERAGTSTY
IDTRTVFLSK		YLKKGNYVLV		PTMFQHGRTS		EFLLRIFSEV		PVQLRELTLD
MPKMSCWNLA		RGYPKVVTQI		TVHSAEDLEK		KYANETVNPY		LVIKCGKEEV
RSPVQKNTVH		AIFDTQAIFY		RRTTDIPIIV		QVWNSRKFCD		QFLGQVTLDA
DPSDCRDLKS		LYLRKKGGPT		AKVKQGHISF		KVISSDDLTE		L

Funkcija

Kalpaini su sveprisutna, dobro konzervirana porodica kalcij-zavisnih cisteinskih proteaza. U sistemu klasifikacije enzima proteaze MEROPS oni su članovi klana CA (proteaze slične papainu). Kalpainski proteini su heterodimeri koji se sastoje od nepromjenjive male podjedinice i varijabilnih velikih podjedinica. Velika podjedinica posjeduje domen cisteinske proteaze, a obje podjedinice posjeduju domene koje vežu kalcij. Kalpaini su uključeni u neurodegenerativne procese, jer njihova aktivacija može biti izazvana prilivom kalcija i [oksidativni stres|[oksidativnim stresom]]. Protein kodiran ovim genom je visoko eksprimiran u placenti. Njegovom C-terminalnom regionu nedostaje bilo kakva homologija sa kalmodulin-sličnim domenom drugih kalpaina. [Proteinu nedostaje kritična katalitska trijada, ostatak na aktivnom mjestu (cisteinski nukleofil mutiran u lizin) i stoga se sugerira da je proteolitski neaktivan. Protein može imati ulogu u formiranju tumora tako što inhibira apoptozu i promovira angiogenezu.