Kalpain-6
| Kalpain-6 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | CAPN6 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 300146 MGI: 1100850 HomoloGene: 7252 GeneCards: CAPN6 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr X: 111.25 – 111.27 Mb | Chr X: 142.59 – 142.61 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Kalpain-6 (znan i kao kalpamodulin) I est protein koji je kod ljudi kodiran genom CAPN6 sa hromosoma X.[5]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 641 aminokiselina, a molekulska težina 74.576 Da.[5]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGPPLKLFKN | QKYQELKQEC | IKDSRLFCDP | TFLPENDSLF | YNRLLPGKVV | ||||
| WKRPQDICDD | PHLIVGNISN | HQLTQGRLGH | KPMVSAFSCL | AVQESHWTKT | ||||
| IPNHKEQEWD | PQKTEKYAGI | FHFRFWHFGE | WTEVVIDDLL | PTINGDLVFS | ||||
| FSTSMNEFWN | ALLEKAYAKL | LGCYEALDGL | TITDIIVDFT | GTLAETVDMQ | ||||
| KGRYTELVEE | KYKLFGELYK | TFTKGGLICC | SIESPNQEEQ | EVETDWGLLK | ||||
| GHTYTMTDIR | KIRLGERLVE | VFSAEKVYMV | RLRNPLGRQE | WSGPWSEISE | ||||
| EWQQLTASDR | KNLGLVMSDD | GEFWMSLEDF | CRNFHKLNVC | RNVNNPIFGR | ||||
| KELESVLGCW | TVDDDPLMNR | SGGCYNNRDT | FLQNPQYIFT | VPEDGHKVIM | ||||
| SLQQKDLRTY | RRMGRPDNYI | IGFELFKVEM | NRKFRLHHLY | IQERAGTSTY | ||||
| IDTRTVFLSK | YLKKGNYVLV | PTMFQHGRTS | EFLLRIFSEV | PVQLRELTLD | ||||
| MPKMSCWNLA | RGYPKVVTQI | TVHSAEDLEK | KYANETVNPY | LVIKCGKEEV | ||||
| RSPVQKNTVH | AIFDTQAIFY | RRTTDIPIIV | QVWNSRKFCD | QFLGQVTLDA | ||||
| DPSDCRDLKS | LYLRKKGGPT | AKVKQGHISF | KVISSDDLTE | L |
Funkcija
[uredi | uredi izvor]Kalpaini su sveprisutna, dobro konzervirana porodica kalcij-zavisnih cisteinskih proteaza. U sistemu klasifikacije enzima proteaze MEROPS oni su članovi klana CA (proteaze slične papainu).[6] Kalpainski proteini su heterodimeri koji se sastoje od nepromjenjive male podjedinice i varijabilnih velikih podjedinica. Velika podjedinica posjeduje domen cisteinske proteaze, a obje podjedinice posjeduju domene koje vežu kalcij. Kalpaini su uključeni u neurodegenerativne procese, jer njihova aktivacija može biti izazvana prilivom kalcija i [oksidativni stres|[oksidativnim stresom]]. Protein kodiran ovim genom je visoko eksprimiran u placenti. Njegovom C-terminalnom regionu nedostaje bilo kakva homologija sa kalmodulin-sličnim domenom drugih kalpaina. [Proteinu nedostaje kritična katalitska trijada, ostatak na aktivnom mjestu (cisteinski nukleofil mutiran u lizin) i stoga se sugerira da je proteolitski neaktivan. Protein može imati ulogu u formiranju tumora tako što inhibira apoptozu i promovira angiogenezu.
Referenca
[uredi | uredi izvor]- 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000077274 - Ensembl, maj 2017
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067276 - Ensembl, maj 2017
- ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- 1 2 "Entrez Gene: Calpain 6". National Center for Biotechnology Information. U.S. National Library of Medicine. Arhivirano s originala, 18. 11. 2020. Pristupljeno 5. 3. 2013.
- ↑ "Summary for clan CA". MEROPS. Pristupljeno 20. 12. 2021.